يحتوى المركز على قاعتي تدريس:

1.  قاعة المحاضرات وتعتبر من أهم أقسام المركز التعليمية حيث يعقد بها المؤتمرات المحلية والدولية بمساحة 200 م2 مزودة باحدث اجهزة وشاشات العرض والكاميرات 
2.  قاعة تدريس أخرى بمساحة 75م2 مزودة بأحدث اجهزة العرض 

تم انشاء دور علمى كامل فى الدور الرابع والخامس ليكون صرحا علميا وثقافيا للسادة الأطباء لتقام به الندوات والمؤتمرات العلمية